人民網(wǎng)海口8月5日電 （王碩）8月1日，海口市發(fā)現(xiàn)1例外省輸入本土新冠肺炎確診病例（輕型）。8月3日，海南醫(yī)學(xué)院新冠病毒測序小組完成此次海口市發(fā)現(xiàn)外省輸入本土新冠肺炎確診病例（輕型）毒株測序及溯源工作，僅用20個小時即獲得了高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)，初步確認(rèn)該毒株屬于德爾塔（Delta）變異株。

為何核酸檢測確診后，還要做基因測序再次確認(rèn)？確認(rèn)毒株對海南防疫工作有哪些幫助？市民面對德爾塔病毒應(yīng)該做些什么？8月4日，人民網(wǎng)記者采訪了海南醫(yī)學(xué)院新冠病毒測序小組測序團(tuán)隊成員。

為什么感染病例核酸檢測呈陽性，還要做基因測序？

“普通的核酸檢測，我們用的方法叫做熒光定量PCR，檢測的時候針對這株病毒相對保守的某一段序列，但是這一段所檢測的結(jié)果只能顯示新冠病毒是否存在及病毒的載量，卻不能夠判斷患者感染的是哪一亞型的新冠病毒，也無法評估它的傳播能力和致病性的強弱。”測序團(tuán)隊成員、海南省醫(yī)學(xué)院易國輝博士說。

易國輝介紹，德爾塔病毒有它特征性的突變位點，確認(rèn)它是什么毒株，主要是從它區(qū)別于其他毒株的變異位點來進(jìn)行比對。如果沒有基因測序技術(shù)把每一個需要確認(rèn)的位點解讀出來的話，就沒辦法判定毒株到底是屬于哪個株系。

“基因測序工作，實際上是將病毒的每個堿基序列都給它解讀出來，那么它從頭到尾長得什么樣子我們都很清楚了”，易國輝說。

易國輝強調(diào)，因為測序工作中，病毒要有一定的載量，才能達(dá)到測序的條件。所以在測序之前都會先做熒光定量PCR（目前常用新冠病毒核酸檢測方法）進(jìn)行病毒含量的估測。“通過核酸檢測結(jié)果，可以看到這個人是否攜帶病毒，以及攜帶病毒載量是高還是低，再通過基因組測序進(jìn)行更深入的研究及分析，獲得毒株的來源、變異情況，進(jìn)而推測其傳播效率和致病能力等信息。”

確認(rèn)感染病例所屬毒株對后續(xù)防疫工作有哪些幫助？

“我們學(xué)校黨委高度重視這次測序工作，測序小組拿到病例樣本后，把它與之前國內(nèi)外發(fā)現(xiàn)毒株序列進(jìn)行比對，構(gòu)建分子進(jìn)化樹，從我們的科學(xué)數(shù)據(jù)分析上來說，可以確認(rèn)該毒株屬于德爾塔（Delta）變異株。”測序團(tuán)隊成員、海南醫(yī)學(xué)院科學(xué)實驗中心副主任張云霞教授說。

張云霞教授告訴記者，實驗室的測序工作關(guān)系到病毒的溯源，關(guān)系到后續(xù)對疫情的研判，以及防疫工作的調(diào)整。

海南醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)藥資源大數(shù)據(jù)中心李永生教授進(jìn)一步介紹：“每一株毒株本身都有它的結(jié)構(gòu)特點，我們知道它的基因組序列以后，就可以進(jìn)行比對分析，從而判斷病毒的傳播路徑。”

據(jù)了解，李永生教授參與指導(dǎo)本次測序工作中數(shù)據(jù)分析。據(jù)李永生介紹，本次海口確診病例毒株測序比對的依據(jù)主要是國際公開的數(shù)據(jù)庫，而海口的這次數(shù)據(jù)也將按規(guī)定上傳國家疾控數(shù)據(jù)庫，為后期對其他新冠變異株的分析研究提供信息積累。

“目前國內(nèi)大多數(shù)疫情的發(fā)生屬于點發(fā)式，更有必要對每一個感染的個體所攜帶的病毒情況做密切的監(jiān)控。”同樣參與了數(shù)據(jù)分析工作的測序工作小組成員尹飛飛教授表示。

尹飛飛進(jìn)一步解釋，如果感染患者所攜帶的毒株在他體內(nèi)發(fā)生了變異，導(dǎo)致它的傳播力增強或者致病性增強的話，一方面，基因組測序工作可以進(jìn)一步完善數(shù)據(jù)庫，另外一方面，對疫情防控決策的調(diào)整和臨床治療方案的制定都具有借鑒意義。“比如說變異株的潛伏期變長了變久了，對密接者的隔離措施和時間就要調(diào)整，比如增加隔離時間，同時我們在臨床治療過程中要相應(yīng)調(diào)整治療方案。

張云霞教授介紹，實施新冠毒株基因組測序，需要具備硬件和軟件兩方面的準(zhǔn)備，重要的一點是要具備相應(yīng)的實驗室條件。

據(jù)了解，根據(jù)國家衛(wèi)生健康委員會發(fā)布的《醫(yī)療機構(gòu)新型冠狀病毒核酸檢測工作手冊（試行第二版）》，開展核酸檢測的實驗室，應(yīng)當(dāng)符合《病原微生物實驗室生物安全管理條例》（國務(wù)院令第424號）和《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室管理辦法》（衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號）的有關(guān)規(guī)定，具備經(jīng)過衛(wèi)生健康行政部門審核備案的生物安全二級及以上實驗室條件，以及臨床基因擴(kuò)增檢驗實驗室條件。

“海南醫(yī)學(xué)院是海南本地目前唯一同時擁有移動生物安全三級實驗室（P3實驗室）和生物安全二級實驗室（P2實驗室）的單位，從技術(shù)力量上來說，醫(yī)學(xué)院校在病原微生物的研究上，也更有優(yōu)勢。”張云霞教授說。

據(jù)了解，海南醫(yī)學(xué)院作為海南省唯一高等醫(yī)學(xué)院校，目前有較完善的學(xué)科配置及基礎(chǔ)研究實力，也承擔(dān)了海南省新發(fā)突發(fā)傳染病基礎(chǔ)研究的任務(wù)。張云霞透露，學(xué)校高度重視新發(fā)突發(fā)傳染病應(yīng)急響應(yīng)平臺的建設(shè)，在人力物力上予以大力支持，目前已經(jīng)形成了一支結(jié)構(gòu)合理的人才隊伍，并積累了理論基礎(chǔ)和豐富的實際操作經(jīng)驗。

記者了解到，根據(jù)海南省新型冠狀病毒肺炎疫情防控工作指揮部要求，2020年8月，海南醫(yī)學(xué)院成立新冠病毒測序小組，并建立病原快速檢測平臺，后續(xù)相繼通過海南省新冠病毒測序及運輸資質(zhì)的審批，此前已多次完成了省疫情指揮部交辦的新冠病毒基因組測序任務(wù)。

從專業(yè)的角度看，海南公眾面對德爾塔變異毒株應(yīng)該做些什么？

“從我的角度去看，我認(rèn)為防護(hù)一定要非常重視，千萬不能掉以輕心”，尹飛飛教授表示。

張云霞教授也提醒大家，日常應(yīng)該戴好口罩勤洗手，養(yǎng)成良好的衛(wèi)生習(xí)慣；盡量避開人群聚集場所；減少外出，盡量不出島。同時，應(yīng)該盡快接種疫苗，建立個人和社會的保護(hù)屏障。

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